La principal función del PUEC-UNAM es la vinculación, lo cual ha permitido que se generen nuevos conocimientos e innovadoras metodologías de planeación y evaluación de las políticas urbanas y territoriales, en particular para la Zona Metropolitana de la Ciudad de México. En esta tarea el PUEC-UNAM incorpora académicos del más alto nivel, procedentes de diferentes disciplinas, forma en la práctica a profesionistas y estudiantes de diversas licenciaturas y posgrados de la UNAM, apoya procesos de actualización para funcionarios y personal del sector público y social, promueve redes de intercambio académico nacional e internacional y difunde valiosas informaciones y conocimientos actualizados a través de sus publicaciones y de la producción de materiales multimedia.
A partir del año 2011 el PUEC-UNAM articula sus actividades sustantivas de manera directa con las líneas rectoras del Plan de Desarrollo de la Universidad (2011-2015) entre las que destacan:
1) Consolidar la posición de vanguardia de la investigación universitaria e incrementar su vinculación con los problemas prioritarios para el desarrollo nacional, para lo cual se han fortalecido los proyectos de investigación colectivos e interdisciplinarios que atienden problemáticas urbanas y territoriales prioritarias;
2) Ampliar la oferta educativa en los campos de la educación continua y la actualización profesional, realizando diplomados y seminarios especializados para capacitar y actualizar urbanistas y profesionales de distintas disciplinas;
3) Incrementar la proyección internacional de la UNAM participando en redes de investigación urbana y territorial y firmando convenios de intercambio académico para profesores y alumnos;
4) Fortalecer la vinculación del trabajo de los universitarios con los sectores público y social. En realidad ésta es la principal tarea del PUEC-UNAM.
Para desarrollar estas líneas, el PUEC-UNAM produce información actualizada y estratégica, promueve procesos de planeación participativa y realiza estudios críticos y propositivos sobre temáticas relevantes del desarrollo urbano y territorial del país.